La Giunta di un'unione di comuni è l'organo esecutivo collegiale dell'ente, composto solitamente dai Sindaci dei comuni aderenti (o da assessori da loro delegati) e presieduta dal Presidente dell'unione. Definisce gli indirizzi politici, gestisce i servizi associati e adotta atti amministrativi in attuazione delle decisioni del Consiglio.

• E' formata dai Sindaci dei comuni che fanno parte dell'unione, garantendo la rappresentanza territoriale, spesso affiancati da assessori nominati.
• Svolge funzioni di governo, attuando i programmi stabiliti dal Consiglio dell'unione e gestendo concretamente i servizi associati (es. polizia locale, gestione rifiuti, servizi sociali).
• Adotta delibere, regolamenti e atti di indirizzo per raggiungere gli obiettivi prefissati dallo statuto dell'unione.
• Mentre il Consiglio dell'Unione ha funzioni di indirizzo e controllo (simile a un consiglio comunale), la Giunta è il braccio operativo, analogo alla giunta comunale in un singolo comune